Les rats sont là où est la nourriture, il est probable qu'il y en ai plusieurs dans ton jardin, et que celui que tu as vu ne soit pas le seul à prendre la gamelle de ta lapine pour une cantine ^^
Effectivement les rats sauvages peuvent transporter des maladies et ils sont plus chasseurs que proies. Il est possible qu'il s'en prenne à ta lapine. Tu pourrais essayer de modifier l'enclos pour les empêcher d'entrer (je n'y crois pas trop, c'est malin ces petites bêtes).
Surveille ta lapine, fais-lui un check-up régulier pour voir s'il n'y a pas de traces de maladie ou d'agression. Je ne sais pas trop quoi te dire d'autre, tu ne pourras pas les faire partir et il y a des chances pour qu'il cohabitent avec ta lapine depuis un petit bout de temps déjà.