Je peux t'apporter un début de réponse :

1. Il faut lui apprendre a faire dans le bac à mon avis elle se met bien dans le bac mais avec les fesses en dehors parfois. Donc pour sa il faut la prendre sur le fait et lui dire de se mettre bien dans son bac, et les crottes les remettre dans la litière.

2. Il doit y avoir un sujet déjà ou quelqu'un sur le forum avait un soucis relativement proche il me semble. Donc à toi de chercher.

3. Tu arrive elle vient vérifier que c'est toi et repart. Ce n'est pas qu'elle n'aime pas rester avec toi, c'est juste que par rapport à elle tu es beaucoup trop grande ! Il faut commencer par s'allonger sur le sol et tu verra elle finira par venir te voir, te monter dessus ! Par contre n'essaye pas de la caresser sinon elle va partir, après tu pourra te mettre assise et elle viendra. Certains lapins sont plus indépendant que d'autres et donc ont besoin de plus ou moins de câlins. Ta lapine doit faire partie des lapins indépendants ! Et puis pour avoir la confiance d'un lapin il faut de la patience !

2. Oui ça se pourrait bien qu'elle marque. Je ne sais pi si ça pourrait t'aider, mais tu peux toujours essayer. Tu prend un petit bout d'essuie-tout, tu le met dans la flaque et le pose dans la litière, dans un coin. Prend là, et met là dans le bac avec sa face vers le bout d'essuie-tout pour qu'elle puisse le sentir. Ensuite ramasse le reste ce que tu dois déjà faire. xD Un seul petit bout suffit. Si tu vois qu'elle le mange, s'est mieux pour son bidou que tu arrêtes cette tactique. ^^

3. Snurp à tout bien expliqué. Si tu veux mon avis, Nixon mon premier lapin, n'a pas une grande confiance en moi. Je suis en train de lui faire comprendre que je suis comme lui. Qu'il n'a pas à avoir peur et me fuir. Kenaï, mon 2e était un vrai pot de colle, mais avec ses hormones et avec la cohabitation, elle m'a délaissé et me fuyait comme Nixon. Je ne savais plus quoi faire. Donc j'ai abandonné. Je ne faisais rien avec eux sauf les nourrirent et les sortir de leur cage. Ensuite j'ai eu Mily, qui elle a tout changé ma perception des lapins. J'ai aussi fait ce qu'on appelle ''parler lapin'' avec elle. Donc avec ça, Mily me prend pour une membre de la garenne à part égale. Et grâce à ça, ça a toujours été très très facile l'éduquer.

J'ai commencé à ''parler lapin'' avec Nixon et Kenaï et maintenant Kenaï n'est plus craintive avec moi. Elle est comme quand elle était bébé en un peu moins pot de colle. Je peux la caresser lorsque je suis debout, elle n'a pas peur. J'ai gagné sa confiance. Nixon s'est encore dur, mais il est beaucoup moins peureux. Je vois énormément de progrès. Même que maintenant, Nixon accepte de me toiletter. Nixon étant le dominant, donc s'est très surprenant.

Quand tu es fâchée, tu lui tournes le dos. [En position ''poule'', tu te retournes, donc tu mets tes fesses dans sa face.] Tu vas voir au début, elle sera offusqué, donc ne fera rien. Mais après un petit moment, elle va venir te voir. Et tu décideras quand tu ne seras plus ''fâchée''. [À faire lorsqu'elle fait des bêtises.] Et tu le fais si tu es déjà au sol avec elle sinon, elle ne va peut-être pas comprendre. Et tu peux ajouter le NON fermement. ^^

Te mettre au niveau du sol, comme l'a dit Snurp, ça aide beaucoup.

Le plus gros truc que je peux te donner, observe là, et imite son comportement. Avec ma lapine ça a très bien fonctionné.

Je ne me rappelle plus ce que je faisais d'autre, mais je peux te donner ces liens qui t'aideront beaucoup à comprendre le comportement et le langage du lapin :
http://margueritecie.com/communication.php
http://margueritecie.com/langage.php

En fait, sur Marguerite, presque tout dans la section éducation est bon à savoir pour comprendre au mieux le lapin. ^^

Et encore la patience est la clé du succès.

Voilà, désolé pour le gros texte! hahaha. Je me sentais inspiré ce matin!

Salut !
Merci beaucoup snurp, ça m'aide assez tes conseils, je vais essayer de les suivre ;)

Et merci aussi Audrey, je vais lire les 2 pages de M&C et m'inspirer de ta technique "parler lapin" pour mieux comprendre ma Vanille 
En fait les petites traces d'urines, c'est même pas des flaques, mais vraiment des petites gouttes séchées sur le sol... Mais après la stérilisation, elle n'aura plus besoin de marquer son territoire, alors j'espère que ça se règlera tout seul.

Encore un dernier merci à toutes les deux !! :D